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基于抗原序列的 ESM 和 PSSM 编码的 B 细胞表位预测工具。
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8
更新时间
2024-09-04
esm生物医药DPMacroverse
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zhangjun19
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Hermite
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App简介
以抗原序列的 ESM2 嵌入和 PSSM 矩阵作为特征,预测B细胞抗原表位。
最佳实践
输入文件示例:
>7lj4_B RSTTLLALLALVLLYLVSGALVFRALEQPHEQQAQRELGEVREKFLRAHPCVSDQELGLLIKEVADALGGGADPETQSTSHSAWDLGSAFFFSGTIITTIGYGNVALRTDAGRLFCIFYALVGIPLFGDILLAGVGDRLGSSLRHGIGHIEAIFLKWHVPPELVRVLSAEMLFLLIGCLLFVLTPTFVFCYMEDWSKLEAIYFVIVTLTTVGFGDYVAGADPRQDSPAYQPLVWFWILLGLPAYFASVLTTIGNWLRVVS >4xak_A GVECDFSPLLSGTPPQVYNFKRLVFTNCNYNLTKLLSLFSVNDFTCSQISPAAIASNCYSSLILDYFSYPLSMKSDLSVSSAGPISQFNYKQSFSNPTCLILATVPHNLTTITKPLKYSYINKCSRFLLSDDRTEVPQLVNANQYSPCVSIVPSTVWEDGDYYRKQLSPLEGGGWLVASGSTVAMTEQLQMGFGITVQYGTDTNSVCPKLEFA
输出文件包括:
输出作图示例:
参考文献
- Clifford, Joakim Nøddeskov et al. “BepiPred-3.0: Improved B-cell epitope prediction using protein language models.” Protein science : a publication of the Protein Society vol. 31,12 (2022): e4497. doi:10.1002/pro.4497
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更新于 2023-10-12
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更新于 2024-01-03
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更新于 2023-06-13
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bohr6ef000
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更新于 2024-09-09
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喇叭花
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更新于 2023-08-01
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ck
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更新于 2024-03-18
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