新建
空间站广场
论文
Notebooks
比赛
课程
Apps
我的主页
我的Notebooks
我的论文库
我的足迹
我的工作空间
任务
节点
文件
数据集
镜像
项目
数据库
B Cell Epitope Prediction Tools
基于抗原序列的 ESM 和 PSSM 编码的 B 细胞表位预测工具。
已订阅
8
更新时间
2024-09-04
esm生物医药DPMacroverse
esm生物医药DPMacroverse
zhangjun19
Hermite
APP介绍
使用手册
讨论区
App简介
以抗原序列的 ESM2 嵌入和 PSSM 矩阵作为特征,预测B细胞抗原表位。
最佳实践
输入文件示例:
>7lj4_B RSTTLLALLALVLLYLVSGALVFRALEQPHEQQAQRELGEVREKFLRAHPCVSDQELGLLIKEVADALGGGADPETQSTSHSAWDLGSAFFFSGTIITTIGYGNVALRTDAGRLFCIFYALVGIPLFGDILLAGVGDRLGSSLRHGIGHIEAIFLKWHVPPELVRVLSAEMLFLLIGCLLFVLTPTFVFCYMEDWSKLEAIYFVIVTLTTVGFGDYVAGADPRQDSPAYQPLVWFWILLGLPAYFASVLTTIGNWLRVVS >4xak_A GVECDFSPLLSGTPPQVYNFKRLVFTNCNYNLTKLLSLFSVNDFTCSQISPAAIASNCYSSLILDYFSYPLSMKSDLSVSSAGPISQFNYKQSFSNPTCLILATVPHNLTTITKPLKYSYINKCSRFLLSDDRTEVPQLVNANQYSPCVSIVPSTVWEDGDYYRKQLSPLEGGGWLVASGSTVAMTEQLQMGFGITVQYGTDTNSVCPKLEFA
输出文件包括:
输出作图示例:
参考文献
- Clifford, Joakim Nøddeskov et al. “BepiPred-3.0: Improved B-cell epitope prediction using protein language models.” Protein science : a publication of the Protein Society vol. 31,12 (2022): e4497. doi:10.1002/pro.4497
引用格式
如用户使用你的App完成相关科研工作,请将引用格式在这里注明:
推荐App
Molecule Recognition
分子结构识别和编辑工具,支持图片和PDF上传Uni-Fold
高精度蛋白质结构预测工具,支持蛋白复合物、同源高聚体预测Uni-View
Uni-View:一个具有编辑、测量、样式定制和图像导出功能的分子可视化工具。Uni-Mol Docking V2
使用Uni-Mol Docking V2进行分子-蛋白配体复合物结构预测。RNA Secondary Structure Prediction
预训练模型与热力学参数优化的高精度RNA二级结构预测工具Uni-Dock
支持极大规模数据库虚拟筛选的高性能对接引擎推荐文章
PTM Predictionmengyue@dp.tech
更新于 2023-10-12
2 转存文件
量子御坂
更新于 2024-01-03
9 赞8 转存文件
Bohrium
更新于 2023-06-13
2 转存文件
bohr6ef000
更新于 2024-09-09
喇叭花
更新于 2023-08-01
ck
更新于 2024-03-18
1 赞1 转存文件