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App简介
应用概述
该应用程序旨在通过图形化界面进行粉末X射线衍射(PXRD)数据的分析和处理。借助Gradio界面的便利性,用户可以上传数据文件并执行多种分析操作,包括数据预处理、数据库查询以及结构精修。此应用专为材料科学研究人员设计,提供了直观且高效的分析途径。
功能简介
- 数据预处理: 能够对PXRD数据进行归一化、基线校正和峰值搜索等常见的预处理操作。
- 数据库查询: 提供基于PXRD图谱对材料数据库的查询,帮助用户在通过实验谱图快速查找材料。
- 结构精修: 通过输入PXRD数据、PRM和初始结构相位,进行基于GSAS II (Ref. 1) 的black-box optimization自动ietveld结构精修分析 (Ref. 2),输出相应的图形结果。
最佳实践
- 数据预处理:
- 上传PXRD数据文件,勾选需要的处理选项如“归一化”、“基线校正”,然后点击“处理数据”按钮。
- 返回处理后的数据结果。
- 数据库查询:
- 选择查询类型(Hanawalt或Fink),设置容差和辐射类型,点击“执行查询”按钮。
- 查询结果以表格形式展示,用户可选择任意一行查看对应结构和谱图峰位置的详细信息。
- 结构精修:
- 用户可以选择初始相位来自上传的CIF文件或者数据库查询后所选择的结构
- 上传需要分析的PXRD数据,还需要额外地上传仪器参数文件(prm格式),如果选择初猜相位来自CIF文件,则还需要上传cif格式的晶体结构文件
- 设置随机种子和试验次数,点击“运行精修”按钮
- 程序将根据每一轮的精修结果,自动调整参数,最终输出Rwp最佳的结果将输出Rwp和Rietveld图,示意精修结果。
参考文献
- Toby & Von Dreele. J. Appl. Cryst. 2013, 46, 544.
- Ozaki, Yoshihiko, et al. npj Comput. Mater. 2020, 6, 1.
- https://github.com/quantumbeam/BBO-Rietveld
- https://github.com/AdvancedPhotonSource/GSAS-II
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