App简介

集成式蛋白质从头设计工作流，该工作流程利用 RFdiffusion 生成新的蛋白质结构，并利用 LigandMPNN 对这些结构进行反折叠，生成完整的蛋白质，包含主链和侧链。该流程包括蛋白骨架生成、序列设计、侧链repack，然后通过 LigandMPNN 对序列进行评分，以评估折叠稳定性。用户只需点击一下鼠标，就能轻松识别潜在有效的蛋白质设计，从而简化了从初始结构生成到候选结构选择的整个过程。

参考文献

如用户使用该App完成相关科研工作，请引用文章：

• Watson, Joseph L., et al. "De novo design of protein structure and function with RFdiffusion." Nature 620.7976 (2023): 1089-1100.
• Dauparas, Justas, et al. "Atomic context-conditioned protein sequence design using LigandMPNN." Biorxiv (2023): 2023-12.
• Dauparas, Justas, et al. "Robust deep learning–based protein sequence design using ProteinMPNN." Science 378.6615 (2022): 49-56.