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作者：Jinghang Wang (电子结构团队实习生) 📨
日期：2024-6-20
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本系列教程参考单斌老师的《计算材料学-从算法原理到代码实现》中的第四章-VASP计算模拟实例，使用国产开源第一性原理软件ABACUS及相关辅助软件包完成一系列计算案例，读者在学习过程中可以配套单斌老师的书或者视频教程对比使用👉 【计算材料学-从算法原理到代码实现】视频教程
本系列教程目录：
一、ABACUS介绍
ABACUS（Atomic-orbtial Based Ab-initio Computation at UStc，中文名原子算筹）是国产开源密度泛函理论软件，相关介绍 ABACUS 的新闻可在ABACUS 新闻稿整理查看，以下是一些常用地址：
ABACUS 在 DeepModeling 社区中的 GitHub 仓库地址为：https://github.com/deepmodeling/abacus-develop
ABACUS 的 Gitee 镜像仓库地址为：https://gitee.com/deepmodeling/abacus-develop
ABACUS 网站访问：http://abacus.ustc.edu.cn/
文档（包括安装方法、输入输出参数介绍、功能介绍、算例介绍、开发者须知等）：https://abacus.deepmodeling.com/en/latest/(https://abacus.deepmodeling.com/en/latest/)。
二、 APEX介绍
- APEX
Alloy Properties EXplorer using simulations （APEX）合金测试工作流，基于dflow科学计算云原生工作流所提供的完备且方便的工作流开发功能，第一性原理计算算子库fpop等工具对合金性质测试流程进行了重构。APEX的安装及功能使用教程可见notebook： 快速上手合金测试工作流APEX，用户可以查看APEX仓库下的README.md来了解更详细的使用说明。
三、ASE-ABACUS及ATST-Tools介绍
ASE (Atomic Simulation Environment)提供了一组用于设置、运行和分析原子模拟的Python工具。ABACUS作为计算器与ASE工具一起使用，可以通过ASE可视化STRU文件、生成与转换STRU文件、调用ABACUS进行计算及读取ABACUS计算结果等。它作为ASE的外部项目存在，并由ABACUS开发人员维护。官方网站见：ASE-ABACUS，使用教程见：ASE-ABACUS接口使用方法介绍 。
ATST-Tools，全称Advanced ASE Transition State Tools for ABACUS and Deep-Potential，是基于ASE调用ABACUS进行过渡态搜索计算的工作流脚本集，涵盖ASE中包含的NEB，AutoNEB和Dimer方法，并预期未来基于ASE以及ASE-ABACUS接口进一步接入或开发其他的过渡态搜索方法。
- ATST-Tools的使用方法见教程： ATST-Tools
- ATST-Tools官网见：https://github.com/QuantumMisaka/ATST-Tools
