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DFT(基于ABACUS)和基于MD(基于DeePMD-kit)的参考资料
ABACUS
DPMD
中文
ABACUSDPMD中文
陈默涵
发布于 2024-05-13
推荐镜像 :ABACUS:3.6.2
推荐机型 :c2_m4_cpu
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1.基础ABACUS使用教程
2.基础DeePMD-kit文档

1.基础ABACUS使用教程

ABACUS使用教程合集:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/5515465115

Bohrium 帮助文档|ABACUS:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6643676733

ABACUS 使用教程|如何转换 STRU 文件:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/9814968648(阙浩辉编写)

ABACUS 使用教程|电子自洽迭代:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/7417640496(阙浩辉编写)

ABACUS 使用教程|结构优化:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/9119461238(阙浩辉编写)

ABACUS 使用教程|DFT+U 计算:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/2112617648(李文菲编写)

ABACUS 使用教程|磁性材料计算:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/7141761751(郑大也编写)

ABACUS 使用教程|分子动力学:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/2241262724(刘裕编写)

快速开始 ABACUS|自洽 能带 态密度 结构优化:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/4641406377(赵天琦编写)

ABACUS 随机波函数 DFT 方法使用教程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/4314634266(陈涛)

ABACUS 无轨道密度泛函理论方法使用教程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6416644691(孙亮)

数值原子轨道(一):ABACUS 中的数值原子轨道命名和使用方法:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/9319634192

数值原子轨道(二):生成给定模守恒赝势的数值原子轨道:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/5215642163

数值原子轨道(三):产生高精度数值原子轨道:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8841868194

ABACUS中的单元测试:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6516435247(赵天琦)

基于开源电子结构软件ABACUS的计算催化实践:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6316830243(石孟超)

2.ABACUS+其他 快速上手使用ABACUS + DP-GEN | init_bulk/run:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/26592976824

一键配置编译ABACUS | toolchain 脚本的使用:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/5215742477

ASE-ABACUS接口使用方法介绍:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6516485694

ABACUS+DPMD+Dflow:Quick Test Semiconductor Melting Point Properties :https://nb.bohrium.dp.tech/detail/2412744832

ABACUS+pyatb 能带反折叠计算:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/2012704420

ABACUS+pyatb:介电函数与线性光学的性质的计算:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/35791425971

ATST-Tools | ABACUS,ASE与过渡态理论的碰撞:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/39369325971

用ABACUS-ASE自动产生能带路径:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1211642609

ABACUS+Phonopy 计算声子谱:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8741867512

ABACUS+LibRI 做杂化泛函计算教程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8041860882

ABACUS+ShengBTE 计算晶格热导率:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/2712467526

ABACUS+Phono3py 计算晶格热导率:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6116471155

ABACUS+Candela 使用教程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/2912697542

ABACUS+DeepH 建立碳材料的哈密顿量模型:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6242632169

2.基础DeePMD-kit文档

Bohrium 帮助文档|DP-GEN:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/3834388649

Bohrium 帮助文档|DP-GEN init:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8144801593

Bohrium 帮助文档|DP-GEN Auto-test:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/3943094499

Bohrium 帮助文档|DP-GEN simplify:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8344803504

DeePMD中的init-model模式:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/1211842527

DeePMD-kit 的 Python 接口使用教程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/3814388661

有问题,就会有答案 —— DeePMD问题汇总及解决思路(初稿):https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8647856224

2.计算实例 DeePMD 使用教程、科研案例、问题收集合集:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/5515485653

从 DFT 到 MD|超详细「深度势能」材料计算上手指南:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6116401077

【WIP】DeePMD 训练与模拟效果分析指南:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/5425347474

ddd!DPA-1遇见指南 | 固态电解质实战之模型训练篇:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8241842097

哥伦布训练营|DPA-1——固态电解质实战之模型训练&性质计算篇:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/7145731165

使用深度势能分子动力学进行固态电解质研究实战:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/7014740428

不优雅地用DP预测标量 | 以原子电荷为例:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/6641686247

LiCoO2正极材料在DFT+U计算中磁基态确定的工作流:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/8549895449

基于深度学习势函数模拟相变存储器的写操作过程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/9619469464

DP-GEN+FEP-TI计算自由能:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/3814388031

3.其他 快速上手使用ABACUS + DP-GEN | init_bulk/run:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/26592976824

利用DeePSPIN训练锂离子电池过渡金属氧化物正极材料的机器学习势函数:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/5341573422

借助DP Combo一键丝滑生成半导体势函数:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/4241482622

DP Combo教程:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/9219742953

DP-Gen based on a DPA-2 pretrained model:https://nb.bohrium.dp.tech/detail/62585747598

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bohr842081
更新于 2024-06-28
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QianbiXiao
更新于 2024-05-27
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