ABACUS使用教程合集

本合集系列主要总结自GitHub@MCresearch/abacus-user-guide，本篇文章修改自该Repo的README.md文件。

本合集旨在为开源密度泛函理论软件ABACUS提供一键即用的云上Notebook教程。标有 Logo的部分可以直接在Bohrium Notebook上打开。

一、介绍

ABACUS（Atomic-orbtial Based Ab-initio Computation at UStc，中文名原子算筹）是国产开源密度泛函理论软件，相关介绍 ABACUS 的新闻可在ABACUS 新闻稿整理查看，以下是一些常用地址：

ABACUS 在 DeepModeling 社区中的 GitHub 仓库地址为：

https://github.com/deepmodeling/abacus-develop

ABACUS 的 Gitee 镜像仓库地址为：

https://gitee.com/deepmodeling/abacus-develop

ABACUS 网站访问：

http://abacus.ustc.edu.cn/

文档（包括安装方法、输入输出参数介绍、功能介绍、算例介绍、开发者须知等）：

https://abacus.deepmodeling.com/en/latest/。

二、ABACUS基本操作教程

1. ABACUS的编译介绍
   1. 官方编译教程
   2. 知乎上用户提供的ABACUS 3.0安装教程
   3. 编译无MPI的ABACUS
   4. 曙光DCU平台编译教程：ABACUS 在曙光 DCU 集群上的编译与使用
   5. 在Bohrium Notebook上快速学习，见快速开始 ABACUS｜自洽 能带 态密度 结构优化；在Bohrium平台上运行大任务，见教程
2. ABACUS建模介绍
   1. 准备晶胞和原子位置等信息的文件STRU：如何转换STRU的格式
   2. 准备赝势： 模守恒赝势生成方法简介
   3. 数值原子轨道基组生成教程：
      1. 数值原子轨道（一）：ABACUS 中的数值原子轨道命名和使用方法
      2. 数值原子轨道（二）：生成给定模守恒赝势的数值原子轨道
      3. 数值原子轨道（三）：产生高精度数值原子轨道
3. Kohn-Sham密度泛函理论
   1. 电子自洽迭代
      1. 平面波PW（缺）
      2. 数值原子轨道LCAO（缺）
   2. 带自旋的体系计算：ABACUS磁性材料计算使用教程
   3. +U计算：ABACUS DFT+U使用教程
   4. 结构优化ABACUS 使用教程｜结构优化
   5. 分子动力学：ABACUS 分子动力学使用教程
4. DeePKS方法（缺）
5. 隐式溶剂计算等相关功能（缺）
6. 随机波函数密度泛函理论：ABACUS 随机波函数DFT方法使用教程
7. 无轨道密度泛函理论：ABACUS 无轨道密度泛函理论方法使用教程
8. 分析结果
   1. 能带计算
      1. 如何正确画能带，NSCF读电荷密度
      2. 用ABACUS-ASE自动产生能带路径
   2. PDOS计算
      1. ABACUS里怎样做DOS和PDOS计算
9. 和其他软件对接
   1. ABACUS+Phonopy 计算声子谱
   2. ABACUS+ShengBTE 计算晶格热导率
   3. ABACUS+DPGEN 使用教程
   4. ABACUS+LibRI 做杂化泛函计算教程
   5. ABACUS+Candela 使用教程
   6. ABACUS+CINEB教程（缺）
      1. ABACUS-ASE做NEB计算 （简单算例）

三、使用经验

1. 有VASP使用背景的用户上手ABACUS教程：ABACUS新人使用的一些注意事项